服務(wù)介紹

通過超聲或酶處理將染色質(zhì)隨機(jī)切割，利用抗原抗體的特異性識(shí)別反應(yīng)，將與目的蛋白相結(jié)合的DNA片段沉淀下來，再通過反交聯(lián)釋放結(jié)合蛋白的DNA片段，最后對(duì)目的DNA片斷進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建，通過高通量測(cè)序的方法獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。

染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序技術(shù)路線

測(cè)序方案

測(cè)序平臺(tái)：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

測(cè)序模式：PE150

測(cè)序數(shù)據(jù)量：8-10 Gb raw data

生物信息分析

基礎(chǔ)分析

測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估（堿基質(zhì)量評(píng)估、序列質(zhì)量評(píng)估）

比對(duì)結(jié)果質(zhì)控檢查

測(cè)序reads全基因組分布圖

結(jié)合峰peak鑒定

結(jié)合峰基因元件分布可視化

富集peak的motif分析

高級(jí)分析（有不同處理?xiàng)l件分組樣本）

差異結(jié)合峰檢測(cè)分析

差異結(jié)合峰相關(guān)基因GO功能富集分析

差異結(jié)合峰相關(guān)基因KEGG生物通路富集分析

差異結(jié)合峰相關(guān)基因Reactome通路分析

部分結(jié)果示例

圖1. peak 在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上下游 3kb 的平均覆蓋度

圖2. peak 在染色體上的分布圖

圖3. De novo motif 分析結(jié)果

Table1.ChIP-seq DNA樣本送樣建議

*更具體的送樣方法請(qǐng)?jiān)斣冧N售或技術(shù)支持

物種范圍：人、小鼠、大鼠，其他物種請(qǐng)?jiān)斣冧N售或技術(shù)支持